可以引起胎儿心脏发育障碍的因素很多。母亲怀孕第2周胎儿心血管系统开始发育，心脏由一个直管道逐渐发育成四个腔（左心房。右心房、左心室、右心室），如果在这段时期遇到一些不良刺激，就可能障碍胎儿心脏的正常发育，导致心脏畸形。
如果在母亲怀孕早期（2个月内）患流行性感冒、风疹、腮腺炎、柯萨奇病毒感染等疾病，就可引起胎儿宫内感染，导致心脏畸形。母亲服用镇静剂、四环素类药、抗癌药或母亲患糖尿病、高血钙以及其它慢性疾病引起宫内缺氧，并与放射性物质接触等都可使小儿患先天性心脏病。因此母孕期必须避免这些不利因素的发生。
