对于多囊肾患者来说，治疗固然重要，但毕竟是遗传的因素占很大程度，所以平时饮食结构的合理安排也是至关重要的，饮食安排合理，可以有效推迟发病的时间，因为发病越早一般症状和病情越是严重。
为此临床上特别强调以下几个方面，辛辣刺激类：如辣椒、酒类、吸烟(包括被动吸烟)、巧克力、咖啡、海鱼、虾、蟹等"发物";过咸类食物，特别是腌制类;被污染的食物如不卫生的食物、腐烂变质的、剩饭剩菜等;烧烤类食物;除此之外，还应限制动物类高蛋白、高脂肪以及油腻类食品，即上述之肥甘厚味;限制豆类及豆制品。
具体的饮食结构安排如下：
尽量戒掉的食品：
1、戒用酒类少用的食品
酒类饮料、酒类、特别是白酒，对于多囊肾患者来讲宜戒掉，酒类对与肾脏的刺激性优为重要。它可以刺激多囊蛋白活性，加速囊肿生长。
2、戒用发酵性食品
发酵性食品、这里所讲的发酵食品主要是菌变发酵的食品，如豆腐乳、臭鸡蛋类。避免食用此类将对囊肿生长速度有利。
3、提倡低蛋白饮食
高蛋白食品、每一种肾病，都应该低蛋白饮食，避免体内氮类代谢物合成，减轻肾脏的排泄力。如大豆、豆腐、以及其他豆类制品。
4、戒用内脏熟食
内脏食品、动物的内脏作成的熟食也不适合多囊肾患者食用，特别是动物肝脏，中国有句传话，吃什么，补什么，其实并不是这样，在宰杀动物过程中很多毒素遗留在肝、肾内，特别是肝脏，肝脏的功能就是解毒，很多动物代谢的毒素都遗留在内脏中，如果病人服用这些物质后无形对肾脏增加负担，加重病情。
5、咖啡、巧克力严禁食用
应该多吃常吃的食品
1、宜常吃，多吃含维生素高的水果蔬菜;
2、含铁丰富的水果蔬菜，如红萝卜等食品;
3、能容石化石的蔬菜食品，如黑木耳等 ;
4、有利尿作用的食品等。
5、碱性食物食用也有辅助作用。
