我国的胃食管反流病发病率低，很大程度上是因为就诊率低。其实，胃食管反流病不仅严重影响生活质量，如果不及时治疗，还潜伏着更大的危险。其中常见的并发症包括：
溃疡：食管溃疡是胃酸反流的结果，部分食管溃疡的患者可以出现出血。
狭窄：反流物可以导致食管出现疤痕和狭窄，导致食管梗阻，使食物或药丸在吞咽时被卡住。食管狭窄经常是由食管反复受损和愈合发展为疤痕组织所造成的。
肺和咽喉疾病：反流物到咽喉部，造成声带的炎症，产生咽痛、声音嘶哑等不适。如果反流物到肺，可造成吸入性肺炎和哮喘症状。慢性酸反流到肺可造成持续的肺损害，形成肺纤维化或支气管扩张症。
