脑动脉硬化、脑变性、脑肿瘤、癫痫等脑器质性疾病，均可伴发抑郁；但大多数不到严重抑郁的程度，多有焦虑、疑病和神经衰弱症状。病史和检查中有脑器质性病变的表现。
脑动脉硬化的病人约有三分之一在不同阶段出现抑郁发作，本病初期患者的人格较为完整，智能损害不重，病情呈波动特点，随着病情的发展，在出现抑郁症状的患者中有5％－10％的患者呈现比较严重和持久的抑郁状态，并伴有意识混浊、情绪不稳，严重时可有出现自责、自罪的表现，部分患者有自杀行为。
脑卒中后抑郁临床表现分为两类，一类是轻度抑郁，表现为悲伤、乏力、睡眠障碍、注意力下降、兴趣减退、思虑过度、情绪易激惹等；另一类是重度抑郁，除了上述轻度抑郁症状外，还有紧张焦虑、早醒、兴趣丧失、思维迟缓、食欲减退、体重减轻、有濒死感及自杀意念，自杀企图是脑卒中后抑郁最危险的症状，可出现在脑卒中后的早期或恢复期，应引起高度注意。
癫痫性抑郁可以在癫痫发作的间隙期出现，称间发性抑郁，患者可以无任可诱因的情况下突然出现抑郁，陷入愁城，常常伴有苦闷性焦虑。此时患者常有自杀和伤害他人的行为，持续数十小时病程外，还可见癫痫的其他表现。在这种心境恶劣的情况下，如有发作性持续饮酒的，称之为间发性酒狂。
震颤麻痹又称帕金森病，发病前可先出现抑郁症状，也可以是同时出现，震颤麻痹所伴发的抑郁表现为苦闷、对前途悲观、易激惹及自杀观念，焦虑症的发生率也很高，但很少有内疚、自责、失败感及被惩罚感。这类病人有较高的自杀意念，但实际自杀率很低。本病的抑郁症可用三环类抗抑郁药治疗，但它可以加重震颤的发生，所以必须加用抗帕金森氏病药物治疗。
