慢性肾炎患者的自然病程变化很大，有一部分病人的病情比较稳定，经5～6年，甚至20～30年，才发展到肾功能不全期，极少数病人可自行缓解。另一部分病人的病情持续发展或反复急性发作，2～3年内即发展到肾功能衰竭。一般认为慢性肾炎的持续性高血压及持续性肾功能减退者预后较差。总之，慢性肾炎是具有进行性倾向的肾小球疾病，预后是比较差的。肾活检的病理学分型对预后的判断比较可靠，一般认为微小病变型肾病和单纯的系膜增殖性肾炎预后较好，膜性肾病进展较慢，其预后较膜增殖性肾炎好，后者大部分病例在数年内出现肾功能不全，局灶性节段性肾小球硬化预后亦差。近年来的研究表明，除了肾小球病变外，肾小管、肾内血管及肾间质病变的程度明显影响预后。肾小管萎缩、肾内小血管硬化、肾间质大量淋巴细胞浸润及间质纤维化则预后较差。
慢性肾炎的一般治疗，首先要鼓励病人树立战胜疾病信心、防止感染，加强休息，避免强体力活动，但要做适当有益活动。其次，对于因慢性肾炎引起水肿的患者来讲，慢性肾炎高血压或肾功能不全者，要限制钠的摄入量，适当控制饮水量，对有大量蛋白尿，患者应提高蛋白质摄入量。肾功能不全者，则应给予优质蛋白质，每日40g左右。总热量应在146.44kj/kg(35佧/公斤体重)左右。除高脂血症者外，脂肪不限，应给足够维生素。轻度浮肿不必给利尿剂，中度以上浮肿者可按病情选用噻嗪类药物，保钾利尿剂(安体舒通、氨苯喋啶)或速尿，可单独或联合应用，剂量宜由小到大，逐渐消肿以防止电解质紊乱。其三，血压高于21.5/13/5kpa,应给予降压药物。其四，抗凝疗法及抗氧化剂的应用;其五、中医中药治疗慢性肾炎的方法是可选用下列中草药或方剂治疗，如金钱草、板兰根、败酱草、蒲公英、当归、丹参、桃仁、红花等，具有清热解毒、消肿利尿、活血化瘀等功效。
