尿毒症患者的性功能障碍的原因有很多且复杂，大致可归因于以下几种因素：
(1)下视丘--脑下垂体--性腺功能异常：在尿毒症患者中因为尿毒素影响内分泌系统，而引起异常;
(2)器质性： 如约有九成的病人有自主神经系统或阴茎血管阻塞的问题，有约56%的患者有严重的性功能障碍，另外有20-30%的患者，有轻度或中等程度的性功能障碍;这些器质性的伤害，可能因为尿毒症或是原先造成慢性肾衰竭的原因致。
(3)尿毒症本身。
(4)尿毒症合并症：如副甲状腺功能亢奋，贫血，心脏血管疾病，中风，感染，营养不良等问题。
(5)疲劳，社会心理因素，忧郁症等问题。
