对临床表现局灶性脑损害而CT扫描阴性的患者，应仔细分析上述因素存在的可能性，正确应用强化扫描，必要时复查CT或作磁共振成像(MRI)检查。所幸的是，早期CT扫描阴性已可有力地排除脑出血、蛛网膜下腔出血、脑脓肿和瘤卒中等病。据作者的经验，如能在此时进行溶栓治疗，常能收到事半功倍之效。
一般认为，脑CT扫描对初期脑出血的阳性率为100%，但对早期脑梗塞病灶的阳性率则为66.5%～89.2%。有少数脑血栓病人，临床表现已十分明显，但CT扫描却为阴性，其主要原因是：
1、发病至CT扫描间隔时间的因素。脑梗塞只有少数病例于血管闭塞后6小时内可查出低密度改变。相当数量的病例于最初24小时甚或3天内并无密度变化，故CT扫描可为阴性。发病后4～14天扫描阳性率最高，显示最佳;2～4周呈等密度现象，CT扫描呈假阴性;4周后密度逐渐下降，终呈脑脊液密度为止;2月后，坏死组织被清除，留下低密度囊腔，病侧脑室扩大。因此，对脑血栓的CT扫描一定要把握时机。
2、病变部位、大小的影响。病变位于脑干和小脑时，可受骨性组织的影响而为阴性。小于5毫米的梗塞灶，难以为 CT所分辨，故扫描阴性。
3、与病变的发展速度有关。某些病人可能因为血管闭塞的缓慢或已有侧支循环建立，其血液循环并非突然中断，病变区脑组织尚未达到缺血坏死水平，或未达到CT所能显示的密度改变，但局部脑组织因血液低灌流而出现功能障碍，出现临床症状体征。
4、CT设备的性能和条件较差，分辨能力较低，也可使部分脑梗塞不能显示出来。
