与脑出血等急性脑血管病相比，脑血栓时消化道出血的发生率较低，约为4.9%～13.7%。病情越重，消化道出血的发生率越高。
应激性溃疡出血的发生机制目前尚未完全阐明，一般多认为是自主神经功能紊乱的结果。
1、丘脑或丘脑下部直接损害：研究人员用实验方法证实刺激下丘脑交感神经中枢(下丘脑前区)时，胃酸分泌增加，胃蠕动增强，张力增加，胃终末血管痉挛，粘膜缺血发生溃疡。从而认为颅内病变波及下丘脑前区自主神经中枢到脑干迷走神经核颅内通路时，易发生消化道溃疡和出血。当脑梗塞直接侵犯上述部位时，即容易引起消化道出血。
2、下丘脑或脑干自主神经的间接受损：主要见于大面积脑梗塞时的脑水肿。临床观察表明，颅压高者、脑疝者和昏迷者并发消化道出血的多，反之则较少或无。说明消化道出血与颅内压增高有关。这是因为颅内压增高可作用于丘脑下部及其下行通路，或使脑干轴性移位，一方面导致下丘脑和脑干受压，另一方面可导致其血循环障碍。
脑血栓时并发消化道出血提示病情重笃，预后不良，应引起高度重视，采取有效措施予以防范。
