脑血栓形成可引起各种脑功能障碍，如肢体瘫痪，语言不清或失语。通过治疗，某些病人很快恢复正常，某些病人留有轻的后遗症，有些病情重者留有严重的后遗症。
一般来说，是否留有后遗症。决定的因素与阻塞的血管的大小，缺血时间，梗塞的部位，病灶的数目及治疗措施等因素有关。比如供应内囊的深穿主动脉缺血，影响内囊部位的供血，该部的神经纤维较集中，管理运动，感觉，语，视觉的纤维都从这里通过 ,是一神经交通要道。因此，这个部位受损害则发生严重的偏瘫，偏身感觉障碍，偏富，即所谓"三偏"症状，还可伴有失语。其缺血程度达到脑组织坏死，则常留有严重的后遗症。若侧支循环建立较好，一般不留后遗症或留有较轻后遗症。后遗症轻重还与急性期治疗早晚;有无并发症，措施是否得力及恢复期功能锻炼情况都有一定的关系。
临床症状：患者发病前曾有肢体发麻，运动不灵、言语不清、眩晕、视物模糊等征象。常于睡眠中或晨起发病，患肢活动无力或不能活动，说话含混不清或失语，喝水发呛。多数病人意识消楚或轻度障碍。面神经及舌下神经麻痹，眼球震颤，肌张力和腹反射减弱或增强，病理反射阳性，腹壁及提睾反射减弱或消失。
