重症肌无力需与以下病症鉴别：
1.眼肌肌营养不良症
先天性眼肌麻痹及功能性眼睑下垂均可与重症肌无力相混淆。以下几点有助于鉴别：①重症肌无力患者不存在肌肉萎缩。②重症肌无力病人的生理反射无明显减弱或消失，尤其初查时。③重症肌无力无感觉障碍。④重症肌无力时眼球各方向转动均受影响，瞳孔大小正常。
2.进行性延髓麻痹
该种病人咽反射消失，伸舌可以偏移，可有肌肉萎缩，但不存在咬肌无力和运动后加重，重症肌无力者相反，咽喉反射健全(尤其初查时)，伸舌不偏，无咬肌、舌肌萎缩，有咬肌无力，易疲劳，休息后好转。
3.多发性肌炎
以下几方面有别于重症肌无力：①有肌肉萎缩。②有肌肉自发疼痛或压痛。③很少累及颅神经支配的肌肉。④激素治疗有效，但抗胆碱酯酶药无效。
