多囊肾患者一般囊肿较多，较小，不适合囊肿穿刺或手术等我科方法治疗。而西医输液或口服药物较少，且效果较差，因此，针对囊肿治疗，大多采用中医保守治疗，来缩小囊肿或延缓囊肿的发展。石家庄肾病医院多囊肾中心专家总结中药治疗多囊肾的一般原则如下，供参考：
(1)扶正固本：多囊肾早期无明显临床症状，或时有腰部不适，或家族中有多囊肾患者，早期偏肾阳虚者补肾壮阳，偏肾阴虚者滋阴补肾。
(2)理气活血：由于水湿瘀积肾内，可阻碍气机，导致气滞血瘀，气血水互结为患，故治疗时应注意理气活血。有血尿者清热止血;腰部瘀块明显者，活血化瘀止痛;腹痛发热者，清热解毒，活血化瘀。
(3)标本兼顾：多囊肾发展至后期，肾用先司，浊毒内停而成关格重症，故有湿浊者应利湿化浊;有水气者，应利水行气。治疗应标本兼顾，固本有滋阴、益气、补肾、健脾等法，治标包括清热、利湿、活血、化瘀、平肝熄风等法。
在应用中药治疗多囊肾的多囊肾专家考虑到口服中药在体内吸收过程较长，且不能专一到达肾脏部位，影响药效发挥;还有由于肾脏本身受到损伤，对药物的敏感度也会下降。因此临床专家考虑如上原因开发出微化中药技术，将药物有效成份直接微化出来;其次再经肾区特殊治疗仪强渗透入肾脏区，减小吸收途径，从而使微化出来的有效成份快速在肾脏部位发挥作用，达到更高的治疗效果。
