在临床中，我们一般把此病为分四期：
第一期是无症状期，只是影像学检查出有多囊肾的存在，但无明显临床症状和表现;
第二期是以高血压为主的症状期：表现为囊肿增大、肾脏肿大、血压升高、腰腹疼痛等症状，其中高血压的出现，常提示肾功能已经(或即将)受损;
第三期是肾功能不全期。表现为血尿素氮、血肌酐升高(血肌酐在133-176umol/L之间为肾功能不全代偿期，而血肌酐继续升高但小于442 umol /L为肾功能不全期)。
第四期是肾衰期，即血肌酐在451 umol /L以上，此后随着血肌酐的逐步升高，而出现相应的症状;
如果血肌酐>707umol/L，则进入尿毒症期。
以上分期是就一般情况而言，具体到每一个患者尚须结合其他表现综合做出判断。临床对多囊肾进行分期，可从宏观上把握此病的发展阶段，由于各期所表现症状不同，病机也有区别，因此治疗时就不能固守一方一药，从而为准确治疗提供依据。
