内邪致瘀也是多囊肾临床症状加重的主要因素，是湿热生瘀。素有气阴不足之体者，感受湿热易夹瘀血为患。湿热易耗伤气阴，气虚则运血无力，血行不畅;阴虚则易蕴内热，煎液成瘀。湿瘀胶结于肾，致病情缠绵难愈。
作为第2致病因素，瘀血形成后反过来又会导致或加重多囊肾的病理改变。如热可致瘀，但瘀血日久亦会化热，即/血瘀经脉，亦久而生热/之意。瘀久亦可化湿成水，所谓/血不利则为水/也。是则邪生瘀，瘀生邪，层层相因，互为因果，致使肾病病机复杂化。其次，邪瘀互结，使病情迁延化。瘀血有形，难以速去。瘀血与六淫互结，使肾病迁延化或慢性化。如/热附血而愈觉缠绵，血得热而愈行胶固/。程振远老教授则认为/既已成瘀，不论初起，已久，总宜散血，血散瘀去，则寒热风湿无遗迹点/。从治疗学角度提出邪瘀互结观点，说明邪之与瘀，矛盾主要方面在瘀血，瘀去则六淫亦去。而《读医随笔》则认为：/瘀血若不祛除，新生之血不能流通，元气终不能复。/又从失治、误治角度阐明了瘀血不仅是邪瘀互结的主要原因，而且是肾病迁延化、慢性化的主要原因。再次，病根在瘀血，使疾病/愈/而复发。/凡物有根逢时必发……瘀血即其根也。故凡复发者，其中必有内伏瘀血。/瘀既有形，邪必假而附之，形成宿根。可以说有一份瘀血未解，就有一份后患未除。即便病已/痊愈/，只要致瘀之机尚存，则必因瘀血而复发。临床上一些血尿、蛋白尿转阴的患者，常因感冒、劳累、节气更替而复发，究其原因仍不外与瘀血存在有关。
瘀血阻肾，则肾络更瘀，影响肾之气化，水液代谢不利，多囊肾蛋白尿、血尿等症状加重。从瘀论治多囊肾应为中医药的着眼点。
对于多囊肾的治疗原则上应根据病因病机的特点辩明瘀血产生的原因考虑立法：根据标本虚实主次，调整治标治本之比例。如痰浊导致瘀血者，宜化痰泄浊活血化瘀;痰水导致瘀血者，宜化痰利水化瘀。兼有风热或风寒者，治宜疏风清热或辛温解表;兼有湿热者，治宜清热利湿;兼有寒湿者，治宜祛寒利湿。病久，本虚为著，治肾为本，兼调肝脾肺，分别气血阴阳不足，参以活血化瘀法调治。
