祖国医学中并无此病证，中医书籍内亦无"多囊肾"的病名，其症状多数散在"腰痛"、"血症"、"腹痛"、"虚劳"等病证之中。本病在并发尿血时，按"血证"诊治，有肋部、腰部或腹部疼痛时，按"腹痛"、"腰痛"论治，症状不明显，或有慢性肾功能不全时，按"虚劳"论治。近10余年来中医运用活血化瘀论治多囊肾取得一定成绩，如石家庄肾病医院报道中药治疗多囊肾临床效果满意，值得深入研究。
多囊肾属先天疾患，乃先天禀赋不足所引起的肾脏发育畸形，故肾虚是其根本原因。此外病理因素还有痰瘀和水，且其间存有互为因果的关系。诚如徐庆暄老中医所言"病血者，未尝不病水;病水者，未尝不病血也"，"瘀血化水，亦发水肿"，无论何种多囊肾，最终必将导致痰、瘀、水三者积于肾脏，而且在三者关系上，更强调瘀在病理中的地位。瘀血可以化生痰水，而致瘀、痰、水互结，肾失所主;同时瘀血可致气血运行受阻，不能正常输布津液，以致痰水内生。从CT显示可为客观指征，尤其伴见尿血症状时，多囊肾的囊壁血管破裂，血液溢于尿液，故瘀血是多囊肾尿血时的基本病理之一。此外，临床检查也表明多囊肾患者血液处于高凝状态，有黏、浓、凝、聚的特点，从微观角度证实了瘀血证的存在。CT的检查也为活血化瘀治疗多囊肾提供了有利的依据。
