有些人常会把脑性瘫痪与智力低下混淆，就是因为他们的症状很相似，从而有不少患者进行了错误的治疗。
智力低下本病常有运动发育落后，动作不协调，原始反射、vojta姿势反射、调正反应和平衡反应异常，在婴儿早期易被误诊为脑瘫，但其智力落后的症状较为突出，肌张力基本正常，无姿势异常，这点完全就可以与小儿脑瘫区别开来。
此外，易与小儿脑瘫想混淆的还有先天性肌弛缓，先天性肌弛缓的患儿在生后即有明显的肌张力低下，肌无力，深腱反射低下或消失。平时常易并发呼吸道感染。本病有时被误诊为张力低下型脑瘫，但后者腱反射一般能引出。
