（１）轮状病毒肠炎
是秋、冬季小儿腹泻最常见的病原。呈散发或小流行，经粪－口传播，也可通过气溶胶形式经呼吸道感染而致病。潜伏期１～３天，多发生在６～２４个月婴幼儿，４岁以上者少见。起病急，常伴发热和上呼吸道感染症状，无明显感染中毒症状。病初１～２天常发生呕吐。随后出现腹泻。大便次数多、量多、水分多，黄色水样或蛋花样便带少量粘液，无腥臭味。常并发脱水、酸中毒及电解质紊乱。本病为自限性疾病，数日后呕吐渐停，腹泻减轻，不喂乳类的患儿恢复更快，自然病程约３～８天，少数较长。大便镜检偶有少量白细胞，感染后１～３天即有大量病毒自大便中排出，最长可达６天。血清抗体一般在感染后３周上升。病毒较难分离，有条件可以直接用电镜检测病毒，或用ＥＬＩＳＡ法检测病毒抗原、抗体，或ＰＣＲ及核酸探针技术检测病毒抗原。
（２）诺沃克病毒性肠炎
主要发病季节为９月～４月，发病年龄１～１０岁，多见于年长儿和成人。潜伏期１～２天，起病急慢不一。可有发热、呼吸道症状。腹泻和呕吐轻重不等，大便量中等，为稀便或水样便，伴有腹痛。病情重者体温较高，伴有乏力、头痛肌肉痛等。本病为自限性疾病，症状持续１～３天。粪便及周围血象检查一般无特殊发现。
（３）产毒性细菌引起的肠炎
多发生在夏季。潜伏期１～２天，起病较急。轻症仅大便次数少增，性状轻微改变。重症腹泻频繁，量多，呈水样或蛋花样混有粘液，镜检无白细胞。伴有呕吐，常发生脱水、电解质和酸碱平衡紊乱。自限性疾病，自然病程３～７天，亦可较长。
（４）侵袭性细菌（包括侵袭性大肠杆菌、空肠弯曲菌、耶尔森菌、鼠伤寒杆菌等）性肠炎
全年均可发病，多见于夏季。潜伏期长短不等。常引起志贺杆菌性痢疾样病变。起病急，高热甚至可以发生热惊厥。腹泻频繁，大便呈粘液状，带脓血，有腥臭味。常伴恶心、呕吐、腹痛和里急后重，可出现严重的中毒症状如高热、意识改变，甚至感染性休克。大便镜检有大量白细胞和数量不等的红细胞。粪便细菌培养可找到相应的致病菌。其中空肠弯曲菌常侵犯空肠和回肠，且有脓血便，腹痛甚剧烈，易误诊为阑尾炎，亦可伴发严重的小肠结肠炎、败血症、肺炎，脑膜炎，心内膜炎，心包炎等。耶尔森菌小肠结肠炎多发生在冬季和早春，可引起淋巴结肿大，亦可产生肠系膜淋巴结炎，症状可与阑尾炎相色，也可引起咽痛和颈淋巴结炎。鼠伤寒沙门菌小肠结肠炎，有胃肠炎型和败血症型，新生儿和＜１岁婴儿尤易感染，新生儿多为败血症型，常引起暴发流行。可排深绿色粘液脓便或白色胶冻样便。
（５）出血性大肠杆菌肠炎
大便次数增多，开始为黄色水样便，后转为血水便，又特殊臭味。大便镜检有大量红细胞，常无白细胞。伴腹痛，个别病例可伴发溶血尿毒综合征和血小板减少性紫癜。
（６）抗生素诱发的肠炎
１）金黄色葡萄球菌肠炎：
多继发于使用抗生素后，病程与症状常与菌群失调的程度有关，有时继发于慢性疾病的基础上。表现为发热、呕吐、腹泻、不同程度中毒症状、脱水和电解质紊乱，甚至发生休克。典型大便为暗绿色，量多带粘液，少数为血便。大便镜检有大量脓细胞和成簇的革兰阳性球菌，培养有葡萄球菌生长，凝固酶阳性。
２）伪膜性小肠结肠炎：
由难辨梭状芽胞杆菌引起。除万古霉素和胃肠道外用的氨基苷类抗生素外，几乎各种抗生素均可诱发此病。可在用药１周内或迟至停药后４～６周发病。亦见于外科手术后、或有肠梗阻、肠套叠、巨结肠等病的体弱患者。本菌大量繁殖，产生毒素Ａ（肠毒素）和毒素Ｂ（细胞毒素）致病。表现为腹泻，轻症大便每日数次，停用抗生素后很快痊愈。重症腹泻，黄绿色水样便，可有伪膜排出，为坏死毒素致肠粘膜坏死所形成的伪膜。粘膜下出血可引起大便带血，可出现脱水、电解质紊乱和酸中毒。伴有腹痛、腹胀和全身中毒症状，甚至发生休克。对可疑病例可行结肠镜检查。大便厌氧菌培养、组织培养法检测细胞毒素可协助确诊。
3）真菌性肠炎：
多为白色念珠菌所致，2岁以下婴儿多见。常并发于其它感染，或肠道菌群失调时。病程迁延，常伴鹅口疮。大便次数增多，黄色稀便，泡沫较多带粘液，有时可见豆腐渣样细块（菌落）。大便镜检有真菌孢子和菌丝，如芽孢数量不多，应进一步以沙氏培养基作真菌培养确诊。
