根据医师治疗经验，严重急性呼吸道症候群（SARS）患者有部分会有轻微的腹泻，多半是软便或者较不成形的粪便，每日一到三次；跟一般的吃坏肚子不太一样。台湾所见的病例，多数在发烧时会伴随有轻微腹泻。有些研究报告指出，在粪便中可找到SARS病毒。
至于如感染SARS是否会肚子痛，医疗界认为，肚子痛和腹泻不是同一个症状，而在报告的病例和统计数据当中，肚子痛的症状并没有被特别提出来，表示大多数的病例应该没有这个症状。
也有人担心SARS在潜伏期是否有传染力，医界目前的研究和资料，没有明显证据可以证明SARS在潜伏期会有传染力，同样的也无法证明潜伏期没有传染力。目前国际医学专家都致力于研究这个问题中。
