感染引起的腹泻分肠道内感染和肠道外感染。
①肠道内感染 主病毒引起要由细菌和。细菌感染中，致病性大肠杆菌是主要致病菌。其次，空肠弯曲菌和小肠结肠炎耶尔森菌是近年来被发现能较常引起腹泻的细菌。其他还有鼠伤寒杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌、枸橼酸杆菌、克雷白菌和难辨梭状芽胞杆菌等。病毒中人类轮状病毒(HRV)是引起秋冬季婴儿腹泻的常见病因。肠道病毒如埃可病毒(ECHO 11、14、18型)、柯萨奇病毒、腺病毒以及冠状病毒等虽可引起腹泻，但非主要病原体，正常小儿肠道中亦常可检出。原虫中如梨形鞭毛虫和结肠小袋虫可引起急性或慢性腹泻。霉菌亦可引起腹泻，其中以白色念珠菌最为常见，大多数在滥用广谱抗生素后发生，体弱者尤为多见。
②肠道外感染 上呼吸道炎、肺炎、肾盂肾炎或中耳炎患儿、由于发热及病原体毒素的影响，使肠内消化酶分泌减少、肠蠕动增加，可引起腹泻。
