癫痫可能自行消失， 永不复发。儿童期开始发作的癫痫，往往如是。事实上，一种儿童期的癫痫，叫做良性儿童期癫痫，通常在少年期后消失;不再复发。其余患者可能终生罹病，不过，其癫痫不一定会经常发作。癫痫虽然不能根治，但是有许多方法可以治疗。
最普通的治疗方法就是按时服用一种或数种药物，每种治疗癫痫的药物都可以预防某一类型的癫痫发作。药物的选择取决于患者的癫痫类型。一般而言，医生总是尽可能只用一种药物，以减少副作用，并防止与其他药物产生抵抗作用;不过，有些患者不得不使用一种以上药物。要有效地预防发作，必须定时服药，以维持药物在体内的效力。
尽管某些类型的癫痫较难控制，但是按时服药的癫痫患者，大约半数能完全防止发作;另有百分之三十的患者发作次数比以往少得多;其余百分之二十的患者服用药物后，病情并未受到控制，原因不明。有些地方设有专门的癫痫治疗中心，有时对那些服药无效或服抗癫痫药出现有害副作用的患者有所帮助。
其他形式的治疗包括外科手术切断胼胝体，以减少参与发作的细胞数目。这是极少采用且又存在争议的办法，仅在其他的治疗方法失败以及该手术不致严重损害脑的正常功能和患者的性格时才施行。除此以外，高脂肪、低碳水化合物(糖和淀粉)的饮食，似乎也对癫痫患者有益，但是有些人厌恶这样的饮食，这样的饮食又可带来讨厌的副作用。
有些患者学习借生物反馈法来控制其癫痫发作。利用这种技术可训练患者控制脑部活动，以图避免发作。此技术尚处于实验阶段，通常与药物治疗并用，不能替代药物治疗。
