病原学依据
1、在急性期从心内膜、心肌心包或心包穿刺液中测出病毒、病毒基因片段或病毒蛋白抗原。
2、病毒抗体：第2份血清中同型病毒抗体(如柯萨奇B组病毒中和抗体或流行性感冒病毒血凝抑制性抗体等)滴度较第 1份血清升高4倍(2份血清应相隔2周以上)或一次抗体效价≥640者为阳性，320者为可疑阳性(如以1:32为基础者则宜以≥256为阳性，128为可疑阳性，根据不同实验室标准作决定)
3、病毒特异性IgM：以≥1:320者为阳性(按各实验室诊断标准，但需在严格质控条件下)。如同时血中肠道病毒核酸阳性者更支持近期病毒感染。
对同时具有上述㈠、㈡(1、2、3中任何一项)、㈢中任何二项，在排除其他原因心肌疾病后，临床上可诊断急性病毒性心肌炎。如同时具有㈣中1、项者，可从病原学上确诊急性病毒性心肌炎;如仅具有㈣中2、3、项者，在病原学上只能拟诊为急性病毒性心肌炎。
如患者有阿斯综合征发作、心力衰竭伴或不伴心肌梗死样心电图改变、心源性休克、急性肾功衰、持续性室速伴低血压或心肌心包炎等一项或多项表现，可诊断为重症病毒性心肌炎。如仅在病毒感染后3周内出现少数早博或轻度T波改变，不宜轻易诊断为急性病毒性心肌炎。
对难以明确诊断者，可长期随访，有条件时可作心内膜心肌活检进行病毒基因检测及病理学检查。
在考虑病毒性心肌炎诊断时，应除外β受体功能亢进、甲状腺功能亢进、二尖瓣脱垂综合征及影响心肌的其他疾患，如风湿性心肌炎、中毒性心肌炎、冠心病、结缔组织病、代谢性疾病以及克山病(克山病地区)等。
