内邪致瘀也是多囊肾临床症状加重的主要因素，是湿热生瘀。素有气阴不足之体者，感受湿热易夹瘀血为患。湿热易耗伤气阴，气虚则运血无力，血行不畅;阴虚则易蕴内热，煎液成瘀。湿瘀胶结于肾，致病情缠绵难愈。
作为第2致病因素，瘀血形成后反过来又会导致或加重多囊肾的病理改变。如热可致瘀，但瘀血日久亦会化热，即"血瘀经脉，亦久而生热"之意。瘀久亦可化湿成水，所谓"血不利则为水"也。是则邪生瘀，瘀生邪，层层相因，互为因果，致使肾病病机复杂化。其次，邪瘀互结，使病情迁延化。瘀血有形，难以速去。瘀血与六淫互结，使肾病迁延化或慢性化。如"热附血而愈觉缠绵，血得热而愈行胶固"。程振远老教授则认为"既已成瘀，不论初起，已久，总宜散血，血散瘀去，则寒热风湿无遗迹点"。从治疗学角度提出邪瘀互结观点，说明邪之与瘀，矛盾主要方面在瘀血，瘀去则六淫亦去。而《读医随笔》则认为："瘀血若不祛除，新生之血不能流通，元气终不能复。"又从失治、误治角度阐明了瘀血不仅是邪瘀互结的主要原因，而且是肾病迁延化、慢性化的主要原因。再次，病根在瘀血，使疾病"愈"而复发。"凡物有根逢时必发……瘀血即其根也。故凡复发者，其中必有内伏瘀血。"瘀既有形，邪必假而附之，形成宿根。可以说有一份瘀血未解，就有一份后患未除。即便病已"痊愈"，只要致瘀之机尚存，则必因瘀血而复发。临床上一些血尿、蛋白尿转阴的患者，常因感冒、劳累、节气更替而复发，究其原因仍不外与瘀血存在有关。
