采用手术(去顶减压手术或抽液固化手术)治疗多囊肾、肾囊肿只是把大的囊肿压迫肾实质的问题暂时解决，不能解决大囊肿去除后所导致的小囊肿因压力减低反而会快速增大的问题。手术疗法仅是权宜之计，带有局限性。怎样才能提高肾囊肿的治疗效果，解决这一医疗难题?
在西医手术治疗不能取得明显效果的情况下，中医中药发挥了其治疗优势，微化中药渗透疗法利用祖国医学内病外治的治疗思维，将高科技技术处理过的原治疗多囊肾的有效中药微化处理，成为具有极强生物活性，并具有靶向定位、针对囊肿病灶进行针对性治疗的治疗方法。
该疗法起到以下两方面的治疗作用：
一、扩张多囊肾周围血管壁上的血管，加速囊壁血液循环，促使囊壁通透性增加;促使囊壁血管内压下降;逆转了因血管内压高于囊内压的压差;加速了囊肿内液的水分向血管中不断的回吸收。
二、微化中药活性物质，抑制了囊肿壁的上皮细胞的继续分泌;阻止了囊壁血管与囊肿继续肿大。
通过以上治疗措施，微化中药活性物质的治疗改善了血管壁与囊肿循环障碍状态，软化了囊壁，增加了囊壁对外的通透性以及抑制囊壁细胞分泌的作用。
微化中药渗透疗法治疗多囊肾有以下四方面的作用：
第一：减少囊肿内液体的形成，减轻对肾小球、肾小管、肾脏血管的压迫，促使受损肾组织的血液循环，改善局部缺氧状态，为加速受损肾组织的修复创造了一种宽松的修复环境。
第二：微化后的中药活性物质，阻断了因囊肿压迫肾脏而导致肾脏纤维化(瘢痕形成)造成肾功能丧失。随着先天性囊肿的逐渐增大，对肾小球、肾小管、肾间质以及肾脏血管的压迫，导致肾脏缺血、缺氧，并启动了受损伤肾脏的纤维化(瘢痕形成)的过程。一旦肾脏纤维化形成，肾脏组织结构就被破坏，肾功能就会丧失。微化中药活性物质治疗多囊肾的关键是：阻断因受囊肿压迫而启动的肾脏纤维化的恶化链，阻断因压迫而导致肾脏缺氧，肾脏损伤的恶性循环，以确保残存肾脏不再受压迫，保护肾功能。
第三：微化中药活性物质可为受损肾脏提供修复物质，如各种维生素、微量元素、有机酸、氨基酸等，加速受损肾脏修复。
第四：微化中药活性物质进入受损肾脏组织中，激活受损组织细胞内的DNA并促使其合成，加速其复制并加速受损组织内蛋白质的合成，完善了微化中药活性物质对受损肾组织的修复及重建机制，加速其重建功能的发挥，促使多囊肾受损肾脏结构的改善，加速受损肾功能的恢复.
