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  细菌是医院获得性肺炎(hospital acquired pneumonia,HAP.简称医院内肺炎nosocomial pneumonia,NP)最常见的病原,占90%以上,真菌、病毒及其他病原体较少见。三分之一为混合感染。3%~26%NP由金葡菌引起。医院内肺炎链球菌肺炎已明显减少,70年代约占31%,近年则降至不足3%。肠球菌肺炎少见,但病情多较严重,耐药率高、治疗困难。革兰阴性杆菌(GNB)占NP病原的50%~80%,主要为肠杆菌科细菌和非发酵菌。肠杆菌科中以肺炎杆菌和大肠杆菌为常见,但分离率有下降趋势;阴沟杆菌耐药率极高,近年发病增加,甚至成为ICU的重要流行株;沙雷菌可污染呼吸器械导致NP暴发流行。非发酵菌中,绿脓杆菌引起的NP约占10%~35%,多见于慢阻肺、人工气道机械通气或免疫功能损害患者,已成为NP首位常见病原菌;洋葱假单胞菌、恶臭假单胞菌和不动杆菌的毒力不如绿脓杆菌,主要引起免疫抑制患者肺炎。以往认为NP中流感杆菌少见,但近年报导气管插管后48~96小时内常发生该菌引起肺炎。军团菌肺炎多为散发病例,国内其发病统计资料较少。厌氧菌所致的NP少见,但个别报告高达35%。我国普通人群结核感染率较高而结核发病的潜伏期又相当之长,住院期间发生的肺结核常很难断定为医院感染。0%~5%的NP由真菌引起,以念珠菌最为常见,约占80%以上,其次为曲菌和毛霉菌感染。呼吸道合胞病毒和流感病毒A可引起NP暴发流行,多见于婴幼儿病房;成人散发病例中以巨细胞病毒为重要,常伴免疫抑制。卡氏肺孢子虫感染少见,几乎均发生于AIDS和器官移植等免疫抑制患者。

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